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Inflammatory response time course, HUVEC (Wada et al., 2009)

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Results for AUGACAC

Z-value: 0.04

Motif logo

miRNA associated with seed AUGACAC

NamemiRBASE accession
MIMAT0003393

Activity profile of AUGACAC motif

TNFa_0h_00minTNFa_0h_15minTNFa_0h_30minTNFa_0h_45minTNFa_1h_00minTNFa_1h_15minTNFa_1h_30minTNFa_1h_45minTNFa_2h_00minTNFa_2h_15minTNFa_2h_30minTNFa_2h_45minTNFa_3h_00minTNFa_3h_15minTNFa_3h_30minTNFa_3h_45minTNFa_4h_00minTNFa_4h_30minTNFa_5h_00minTNFa_5h_30minTNFa_6h_00minTNFa_6h_30minTNFa_7h_00minTNFa_7h_30minTNFa_8h_00min−0.02−0.015−0.01−0.00500.0050.010.0150.020.025
activity (log2(tpm) per TFBS)

Sorted Z-values of AUGACAC motif

−0.0500.050.1TNFa_2h_45minTNFa_0h_30minTNFa_2h_00minTNFa_3h_00minTNFa_3h_15minTNFa_1h_45minTNFa_8h_00minTNFa_4h_30minTNFa_0h_45minTNFa_1h_30minTNFa_1h_00minTNFa_7h_00minTNFa_2h_15minTNFa_3h_30minTNFa_1h_15minTNFa_4h_00minTNFa_6h_00minTNFa_0h_00minTNFa_2h_30minTNFa_6h_30minTNFa_7h_30minTNFa_3h_45minTNFa_5h_00minTNFa_0h_15minTNFa_5h_30min
Z-value

Network of associatons between targets according to the STRING database.

First level regulatory network of AUGACAC

PNG image of the network

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Gene Ontology Analysis