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Inflammatory response time course, HUVEC (Wada et al., 2009)

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Results for GCCUGUC

Z-value: 0.09

Motif logo

miRNA associated with seed GCCUGUC

NamemiRBASE accession
MIMAT0004564

Activity profile of GCCUGUC motif

TNFa_0h_00minTNFa_0h_15minTNFa_0h_30minTNFa_0h_45minTNFa_1h_00minTNFa_1h_15minTNFa_1h_30minTNFa_1h_45minTNFa_2h_00minTNFa_2h_15minTNFa_2h_30minTNFa_2h_45minTNFa_3h_00minTNFa_3h_15minTNFa_3h_30minTNFa_3h_45minTNFa_4h_00minTNFa_4h_30minTNFa_5h_00minTNFa_5h_30minTNFa_6h_00minTNFa_6h_30minTNFa_7h_00minTNFa_7h_30minTNFa_8h_00min−0.02−0.0100.010.02
activity (log2(tpm) per TFBS)

Sorted Z-values of GCCUGUC motif

−0.2−0.15−0.1−0.0500.050.10.150.2TNFa_3h_30minTNFa_7h_00minTNFa_2h_45minTNFa_0h_00minTNFa_6h_00minTNFa_4h_00minTNFa_5h_00minTNFa_7h_30minTNFa_1h_00minTNFa_1h_30minTNFa_4h_30minTNFa_0h_45minTNFa_3h_00minTNFa_5h_30minTNFa_1h_45minTNFa_8h_00minTNFa_1h_15minTNFa_2h_30minTNFa_3h_15minTNFa_2h_00minTNFa_6h_30minTNFa_0h_15minTNFa_0h_30minTNFa_3h_45minTNFa_2h_15min
Z-value

Network of associatons between targets according to the STRING database.

First level regulatory network of GCCUGUC

PNG image of the network

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Gene Ontology Analysis